1、生物污染
生物污染是指生活污水、糞便垃圾、生物制品廠、牲畜養殖場、屠宰廠等污水、廢水中含有大量的病原微生物，如細菌、病毒、支原體、寄生蟲等，在未經無害化處理的情況下，直接排入環境，從而引起的水源污染。

該類污染可能導致某些介水傳染的疾病，包括：傷寒、副傷寒、沙門菌病、腸熱、痢疾、霍亂、甲型肝炎、蛔蟲病、病毒流行性腹瀉等。自來水在經加氯消毒后，如供水管網沒有二次污染，一般可將該類污染的危害控制在一定的范圍內。 

2、化學污染
化學污染包括以重金屬為主的無機物污染與人工合成的有機物污染。該類污染的危害與微生物所造成的污染不同，其對健康的危害是潛在的，特別是蓄積性毒物和致癌物質。

人工合成的有機物種類繁多，部分結構穩定，在環境中需要幾年乃至幾十年的時間才能降解完全，長期殘留在環境中。多種人工合成的有機物具有致癌、致畸、致突變作用和毒性，對健康產生潛在危害。

據WHO報道，世界水體中可檢查出2221種化學物質，其中飲水中有害有機污染物765種，經鑒定確認其中致癌物20種，可疑致癌物23種，致突變物56種，促癌劑18種。

南京地區飲用水源長江已經處于下游，遭受了沿途各種有機和無機污染的下游，水質已經今非昔比。

該類污染在目前傳統的自來水處理工藝現狀下，無法去除。 

3、環境內分泌干擾物
研究發現某些化學品還會嚴重干擾人類和動物的生殖功能，對人類的生存和物種繁衍構成巨大威脅，這類物質被稱為“內分泌干擾物”或“環境荷爾蒙”。典型物質有艾氏劑、異狄氏劑、毒殺芬、氯丹、滅蟻靈、DDT、666、多氯聯苯等。

這類物質能干擾機體內的激素的合成、釋放、分泌、轉運、結合、效應或清除等過程，與生物體本身的激素競爭細胞上的受體而產生阻礙作用，從而破壞機體的正常平衡，影響動物和人體生殖、發育或行為等多方面功能。

內分泌干擾物主要是農藥、除草劑、滅菌劑、涂料、塑料增固劑等，在野生動物方面已經導致海豹、海豚、禿鷹、水貂等動物大量死亡。

該類污染在目前傳統的自來水處理工藝現狀下，無法去除。 

4、其他值得關注的污染物
1）甲基叔丁醚

該物質是目前汽油中添加劑鉛的替代物，已經被證實是強致癌物，主要通過城市路網的加油站、輸油管、儲油罐的泄漏，污染地下水從而進入環境。

美國和日本地下水中已經檢出，而我國使用無鉛汽油時間尚短，在新的水質標準中還未得到重視。

2）藻毒素

我國絕大多數湖泊、水庫都遭到不同程度污染，水中氮、磷含量增多，致使藻類瘋長。一些藻類能產生毒素，其中微囊藻毒素最為多見，它的生物活性之一是肝毒作用，可引起急性肝中毒，有極強促進肝癌形成作用。

3）抗生素

當前國際社會普遍關注水中抗生素的問題。細菌、病毒長期暴露在微濃度的抗生素環境下，將逐漸產生抗藥基因，人體內積累抗生素，今后人類得病后，現有抗生素的有效性值得懷疑。北京大學胡建英教授已在鄭州的黃河水源中檢出抗生素。

4）微生物污染

主要是指新發現的一些微生物物種，包括軍團菌、隱孢子蟲、賈第鞭毛蟲等。因其有堅硬的外殼，并具有一定的抗氯性，一般自來水處理工藝無法將其去除，甚至抗生素都不能進入其體內，將其殺死。

它們通過飲用被污染的水或接觸傳播到人的腸道內，人染病后的癥狀主要有：身體疼痛、排氣、腫脹、體重下降、嘔吐、低燒和嚴重性脫水腹瀉。健康的人一般持續發病10～14天，然后恢復正常。

以上4種污染屬于新發現污染，目前自來水處理工藝一般都不能去除該類污染